当江河湖泊出现富营养化，大概率存在磷、氮超标现象了。水体富营养化是一种生态失衡现象。容易造成水生生物死亡，进而对周边的整个生态系统造成进一步污染及破坏。
目前对江河湖泊总磷超标治理主要采用生物除磷、物理除磷及化学除磷。
生物除磷：利用聚磷菌在厌氧状态释放磷，在好氧状态从外部摄取磷，并将其以聚合形态储藏在体内，形成高磷污泥，排出系统，达到从废水中除磷的效果。
絮凝沉淀型除磷：利用具有生物絮凝作用的微生物对水中溶解态磷进行吸附形成颗粒态磷，经凝聚转为沉淀。主要是创造微生物适宜的生存环境和稳定附着条件。
物理除磷：最最直观和常用的方式是-清淤。将水中磷通过清淤的方式进行转移。主要是从水体中转移到土壤中。再通过植物吸收的方式进行处理。
化学除磷：化学除磷在污水处理中应用得十分普遍。化学除磷能把有机磷给有效结合起来进行沉降与凝析。但由于江河湖泊中存存在碳酸根、有机酸等组分能够与磷酸根竞争钙镁等离子，且水量大、流动性强。因此，一般采用临时性除磷和永固性除磷两种。
临时性除磷主要是投加聚合硫酸铁/聚合氯化铝等具有快速除磷作用的化学絮凝剂，使水中磷形成难溶磷酸盐。此法对江河湖泊磷处理会在河床上形成泥水隔离层。
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