有机物、碳源、温度对生物除磷的影响
有机物质浓度
水中有机物的浓度是影响厌氧磷释放的另一个因素，某大学的一个研究小组调查了农村和城市污水的水质，发现流入TKN/COD0.14，即使采用UCT工艺，其脱磷效果也很差。当然，该比率基于南非的城市污水成分，在其他国家/地区中，污水中易生物降解的底物的浓度会有所不同，其比例也会相应改变。据报道，当TKN/COD为0.13时，西欧脱磷工厂具有良好的脱磷效果。
碳源类型和浓度
废水中有机物的成分，特别是其生物降解性，极大地影响了除磷过程的性能。生物除磷的机理表明，生物除磷需要足够的碳源以满足聚磷菌厌氧段的磷释放要求。同样，如果不合成细胞内聚合物，就不能消除无效的磷释放。富磷细菌用于易分解的小分子，并且它们触发磷释放的能力比有机物强得多，有机物在高分子量时难以分解。
最近的研究表明，在生物去磷酸化中，由于聚磷菌和聚糖菌之间的竞争而导致的不同类型碳源之间的竞争，会导致不同碳源释放出不同程度的磷。GAOs吸收水中的有机物并在厌氧区合成PHAs，但不会释放磷。当聚糖菌在竞争中占主导地位时，污泥的磷释放能力将大大降低。当C/P比超过50 mg COD/mgP时，除磷效率降低，这主要是因为聚糖细菌目前具有足够的碳源来支持其生长。
温度
低温下聚磷菌的生长速度很慢，但是温度对生物除磷的影响很小。根据某污水处理厂的数据，即使水的温度降至8～9℃，污水中的磷也低于2 mg/L，温度对除磷的影响主要是影响发酵细菌的产酸。另外，如果需要同时进行脱氮，则必须实现硝化，这需要减少负荷并延长泥龄。结果减少了酸的产生并影响了脱磷作用，解决方案是添加一个外部VFA。污水处理厂采用的方法是添加含有大量VFA的污泥浓缩池的上清液，从而可以在寒冷的天气中同时去除氮和磷。
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