在污水除磷中通常以生化除磷和化学除磷两种方式为主，化学除磷是投加化学除磷药剂使磷以不溶性固体沉淀物形态从污水中分离出去。生物除磷是在厌氧条件下释放磷及好氧条件下蓄积磷的作用除去水中的磷。即使磷以溶解态为微生物所摄取，与微生物成为一体，并随同微生物从污水中分离。
1.在长期运行上，成本上生物除磷更加经济，化学除磷剂需要不断的消耗，单从这一点看，化学除磷成本较高。
2.化学药剂与磷反应产生沉淀相对生物除磷产泥量会高一点。
3.生物除除磷的范围广，在污水中的磷的存在形式有正磷酸盐、偏磷酸盐和有机磷酸盐。化学沉淀除磷主要针对的是正磷酸盐，对其它形态的磷的作用不大。但是生物除磷可以将这些磷都转化为正磷酸盐。
4.效果上生物除磷出水一般达到1mg/L,化学除磷可以达到0.03mg/L,在生化没办法达标处理的，可投加化学除磷剂。
5.从稳定上看，微生物除磷容易受环境变化及水质水量波动影响，出现出水超标，生化系统崩溃等现象。对水质及环境稳定性要求较高。化学除磷效果稳定且适应性强。
这也是我们在污水处理中通常看到的，以生化除磷为主，以化学除磷为辅的现象。即能达标排放，又兼具经济性。
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