我们通常讲的除磷剂是指化学除磷剂，而实际上应用得比较多的还有微生物除磷剂/除磷菌。化学除磷剂可以是一种特定的除磷药剂，也可以是所以具有除磷效果的一类药剂的统称。
化学除磷剂的除磷原理
其原理是化学混凝原理和化学沉析原理（利用化学除磷剂水解后生成的带电离子及胶体物质，与水中悬浮物发生电中和、双电层压缩、吸附架桥、絮凝沉降反应，形成难溶性金属盐沉淀，再经固液分离，形成沉淀污泥，从水体中排出。）
微生物除磷原理
微生物除磷主要是利用聚磷菌通过在新陈代谢过程中吸收及释放水中磷的原理进行除磷的。具体表现为聚磷细菌通过缺氧状态下吸收挥发性脂肪酸，同时释放出存储的磷，在有氧状态下，聚磷细菌吸收水中磷。生物除磷就需要保证聚磷细菌能正常生长繁殖，而充足的挥发性脂肪酸可以让其在厌氧区顺利释放磷。
微生物除磷具有环保无害、成本低、效果好而备受欢迎，但在除磷速度及适应性上就不如化学除磷剂了，因此，在实际应用中，通常会选择生化除磷+化学除磷相配合。
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